Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
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