Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms