Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms