Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COG7P83436 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COG7P83436 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COG7P83436 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COG7P83436 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COG7P83436 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COG7P83436 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COG7P83436 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COG7P83436 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COG7P83436 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COG7P83436 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COG7P83436 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COG7P83436 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COG7P83436 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COG7P83436 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COG7P83436 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COG7P83436 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COG7P83436 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COG7P83436 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COG7P83436 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COG7P83436 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COG7P83436 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COG7P83436 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COG7P83436 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COG7P83436 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COG7P83436 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COG7P83436 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COG7P83436 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COG7P83436 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COG7P83436 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COG7P83436 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COG7P83436 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COG7P83436 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COG7P83436 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COG7P83436 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COG7P83436 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COG7P83436 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COG7P83436 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COG7P83436 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COG7P83436 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COG7P83436 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COG7P83436 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COG7P83436 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COG7P83436 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COG7P83436 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COG7P83436 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COG7P83436 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COG7P83436 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COG7P83436 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COG7P83436 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COG7P83436 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COG7P83436 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COG7P83436 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COG7P83436 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COG7P83436 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COG7P83436 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COG7P83436 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COG7P83436 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COG7P83436 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COG7P83436 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COG7P83436 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COG7P83436 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COG7P83436 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COG7P83436 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms