Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGCXP38435 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms