Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDIT3P35638 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms