Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 AL157902.2-201ENST00000623435 1492 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 TRMT13-201ENST00000370139 711 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 LINC01098-201ENST00000507870 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 AC105430.1-202ENST00000567477 483 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD46P15529 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD46P15529 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD46P15529 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD46P15529 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD46P15529 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD46P15529 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD46P15529 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD46P15529 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD46P15529 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD46P15529 DDX27-201ENST00000371764 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD46P15529 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD46P15529 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD46P15529 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD46P15529 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD46P15529 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD46P15529 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD46P15529 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD46P15529 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD46P15529 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD46P15529 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD46P15529 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CD46P15529 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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