Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UPP2O95045 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
UPP2O95045 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
UPP2O95045 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
UPP2O95045 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPP2O95045 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms