Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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PDE6DO43924 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PDE6DO43924 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PDE6DO43924 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PDE6DO43924 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PDE6DO43924 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PDE6DO43924 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PDE6DO43924 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PDE6DO43924 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PDE6DO43924 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PDE6DO43924 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PDE6DO43924 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PDE6DO43924 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PDE6DO43924 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PDE6DO43924 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PDE6DO43924 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PDE6DO43924 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PDE6DO43924 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PDE6DO43924 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PDE6DO43924 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PDE6DO43924 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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PDE6DO43924 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PDE6DO43924 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PDE6DO43924 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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PDE6DO43924 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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PDE6DO43924 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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PDE6DO43924 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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PDE6DO43924 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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PDE6DO43924 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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PDE6DO43924 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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PDE6DO43924 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PDE6DO43924 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PDE6DO43924 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PDE6DO43924 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PDE6DO43924 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PDE6DO43924 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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