Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms