Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms