Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AC022121.1-201ENST00000484584 579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AC022966.2-201ENST00000587434 367 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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