Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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