Protein–RNA interactions for Protein: P61077

UBE2D3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D3P61077 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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UBE2D3P61077 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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