Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms