Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms