Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.1 ms