Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CBLN3Q6UW01 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CBLN3Q6UW01 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CBLN3Q6UW01 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBLN3Q6UW01 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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