Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms