Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms