Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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