Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms