Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms