Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC8Q9BY41 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC8Q9BY41 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC8Q9BY41 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC8Q9BY41 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC8Q9BY41 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC8Q9BY41 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC8Q9BY41 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC8Q9BY41 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC8Q9BY41 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC8Q9BY41 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC8Q9BY41 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC8Q9BY41 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC8Q9BY41 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC8Q9BY41 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDAC8Q9BY41 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms