Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
TMEM43Q9BTV4 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM43Q9BTV4 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM43Q9BTV4 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM43Q9BTV4 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM43Q9BTV4 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM43Q9BTV4 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM43Q9BTV4 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM43Q9BTV4 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM43Q9BTV4 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM43Q9BTV4 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM43Q9BTV4 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 502 ms