Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms