Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms