Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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SH3BP1Q9Y3L3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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SH3BP1Q9Y3L3 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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