Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms