Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms