Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P3H3Q8IVL6 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P3H3Q8IVL6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
P3H3Q8IVL6 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P3H3Q8IVL6 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
P3H3Q8IVL6 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H3Q8IVL6 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms