Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBAP2Q5T6F2 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms