Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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