Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms