Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC019185.2-201ENST00000424628 520 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC016027.1-201ENST00000426483 805 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 TMBIM6-225ENST00000552370 882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 TRAM2-AS1-202ENST00000605910 1053 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 NUDT7-207ENST00000613075 1073 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 TDRD12-201ENST00000421545 1317 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 RNU1-38P-201ENST00000362817 144 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC007036.3-201ENST00000511893 614 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AP001124.1-201ENST00000529628 385 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 COMMD6-205ENST00000406936 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms