Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJC1P36383 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms