Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ST6GAL2-201ENST00000361686 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms