Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms