Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms