Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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RPE65Q16518 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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RPE65Q16518 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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RPE65Q16518 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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RPE65Q16518 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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RPE65Q16518 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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RPE65Q16518 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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RPE65Q16518 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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