Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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