Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SPIDRQ14159 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SPIDRQ14159 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SPIDRQ14159 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SPIDRQ14159 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SPIDRQ14159 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SPIDRQ14159 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SPIDRQ14159 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SPIDRQ14159 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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