Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP4P49662 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP4P49662 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP4P49662 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP4P49662 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP4P49662 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP4P49662 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP4P49662 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP4P49662 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP4P49662 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP4P49662 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP4P49662 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP4P49662 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP4P49662 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP4P49662 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP4P49662 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP4P49662 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP4P49662 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP4P49662 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP4P49662 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP4P49662 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP4P49662 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP4P49662 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP4P49662 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP4P49662 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP4P49662 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP4P49662 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP4P49662 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms