Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLMP48507 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms