Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCP2P22307 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCP2P22307 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCP2P22307 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCP2P22307 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCP2P22307 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCP2P22307 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCP2P22307 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCP2P22307 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCP2P22307 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCP2P22307 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCP2P22307 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCP2P22307 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCP2P22307 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCP2P22307 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCP2P22307 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCP2P22307 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCP2P22307 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCP2P22307 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCP2P22307 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCP2P22307 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCP2P22307 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCP2P22307 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCP2P22307 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCP2P22307 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCP2P22307 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCP2P22307 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCP2P22307 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCP2P22307 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCP2P22307 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCP2P22307 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCP2P22307 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCP2P22307 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCP2P22307 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCP2P22307 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCP2P22307 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCP2P22307 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCP2P22307 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCP2P22307 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCP2P22307 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCP2P22307 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCP2P22307 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCP2P22307 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCP2P22307 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCP2P22307 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCP2P22307 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCP2P22307 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCP2P22307 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCP2P22307 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCP2P22307 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCP2P22307 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCP2P22307 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCP2P22307 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCP2P22307 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCP2P22307 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCP2P22307 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCP2P22307 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCP2P22307 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCP2P22307 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCP2P22307 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCP2P22307 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCP2P22307 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCP2P22307 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCP2P22307 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms