Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SMAD6O43541 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SMAD6O43541 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SMAD6O43541 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SMAD6O43541 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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SMAD6O43541 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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SMAD6O43541 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SMAD6O43541 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SMAD6O43541 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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