Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
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GTF3C6Q969F1 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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GTF3C6Q969F1 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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GTF3C6Q969F1 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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GTF3C6Q969F1 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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GTF3C6Q969F1 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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GTF3C6Q969F1 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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GTF3C6Q969F1 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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GTF3C6Q969F1 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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