Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms