Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms