Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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